结合自己的开发经验给出几点建议：
AD转换时间应当大于64us（预分频决定），如果采样保持时间短，采集结果可能不准确；
应该让采集电压源尽量保持稳定； （是让采样保持电路稳定。）
AVCC和VCC之间的电压差不得超过0.3V，否则采样值波动会很大；
在采样的过程中，不要有数字电路的操作，比如IO口赋值等；
如果有可能，请使用外部参考电压源；
选择合适的参考电压值，比如测1.5V电压，参考电压为2V就比较合适；
如果AD采样要求较高，被测电路与芯片工作电路分开供电。
调试的过程中不要有JTAG的参与，JTAG会影响采样结果，应该将程序直接烧录到单片机中，用串口或者LED等查看结果。
按照以上建议，可以提高AD转换精度。