1、大多数单片机都只有系统时钟一个。就是CPU的各节拍工作时序的驱动源了。这个频率一般为几MHz。速度比较快，其目的无非是让单片机快点干活。那为啥不是GHz数量呢，这个是集成电路工艺决定的。根据工艺反推出某款单片机的理想工作频率，往往也是最佳工作频率了。系统在这个频率下工作又快（已达最佳极限）又稳定。最好地体现了计算机的高速运算能力。
2、实时时钟，是单片机计时的时钟或独立的可被单片机访问的时钟。它可以外部扩展芯片得到，如1302,1307,12887,3130,12020，m41t81,6902,8025。有并口有串口，有带电池自己玩，有外部供电，看实际需要设计。这些时钟无一例外地用到了32768Hz。这是因为它们用了同一个计时IC核、低频功耗更低、更容易校表和1Hz计时精密实现。大伙在该基础上做了不同的文章，有的搞点稳定晶振放里面，有的搞点备电方案，有的接口不同，有的搞点万年历，有的搞点报警，有的……
3、还有可能你提到的（可能就是430系列单片机），内部集成了RTC这个模块，要求外面接32768Hz。这样就可以独立地计时，单片机睡觉了也和它的时间管理无关，低成本实时方案，又省了好几毛。
综上：
【1】系统时钟就是CPU时钟，RTC时钟就是计时时钟。
【2】系统时钟的目的是高速稳定，而实时时钟目的是低功耗精确。